Postdoctoral researcher on bioinformatics analysis of multi-omics data

Centre de Recherche l'hôpital maisonneuve-Rosemont, Université de Montéal
Medicine
CanadaQuébecMontréal
sites.google.com/view/tanakalab/home

Description

(English)
We are looking for a collaborative and self-motivated Postdoctoral Associate/Fellow to work in the laboratory of Dr. Yoshiaki Tanaka in Maisonneuve-Rosemont Hospital Research Center at University of Montreal in Canada. The Tanaka lab aims to gain molecular insights of cancer progression and invasion using genomic and computational platforms. The successful candidate will be involved in the international collaborative project, “Modeling Human Multi-Organ Interaction in Disease - Cancer Cachexia (MORGI)” and will closely work with Dr. Tor Erik Rusten at University of Oslo in Norway. Cancer Carchexia (CC) is a multi-organ disorder that leads metabolic reprogramming, systemic inflammation, and organ degeneration. The successful candidate will conduct large-scale bioinformatics analysis of multi-omics datasets (e.g. transcriptomics, proteomics, and metabolomics) from CC models and development of mathematical models to integrate these multi-omics datasets. He/She will be also responsible for designing of analytic pipelines, data interpretation, data organization, and manuscript preparation.

More information of this project can be found at the following link:
www.uio.no/english/research/strategic-research-areas/life-science/research/convergence-environments/morgi/.

(French)
Nous cherchons un.e postdoc collaboratif.ive et motivé.e, qui va travailler dans le laboratoire du Dr Yoshiaki Tanaka au Centre de Recherche de l’Hôpital Maisonneuve-Rosemont à l’Université de Montréal au Canada. Le laboratoire vise à étudier les mécanismes moléculaires de la progression et de l’invasion de la tumeur en utilisant des méthodologies génomiques et mathématiques. La personne retenue va contribuer au projet international intitulé, « La Modélisation de l’interaction multi-organes chez les humains dans la cachexie cancéreuse (MORGI) » et va travailler en collaboration avec le Dr Tor Erik Rusten de l’Université d’Oslo en Norvège. La cachexie cancéreuse (CC) est une maladie multi-organes qui cause la reprogrammation métabolique, l’inflammation systématique et la dégénération d’organe. Le ou la candidat.e sélectionné.e fera l’analyse bio-informatique des données des multi-omiques à grande échelle (ex. transcriptomiques, protéomiques et métabolomiques) des CC modèles et développera les modèles mathématiques pour intégrer les données des multi-omiques. Il/elle sera aussi responsable de concevoir le pipeline analytique, l’interprétation des données et la préparation d’article.

Informations supplémentaires du projet dans le lien suivant :
www.uio.no/english/research/strategic-research-areas/life-science/research/convergence-environments/morgi/.


Qualifications

(English)
Applicants must hold a degree equivalent to a Norwegian doctoral degree in molecular biology, cell biology, computer science, or similar directly relevant disciplines for the position. Appointment is dependent on the public defense of the doctoral thesis being approved. The candidate should be highly motivated and dedicated, and should have strong collaboration skills.

The following qualifications will count in the assessment of the applicants:
1. Bioinformatics analysis of next-generation sequencing data (e.g. RNA-seq, ATAC-seq)
2. Computational programming, such as python, R, and other programming languages
3. Knowledge of basic biology and health science
4. Excellent oral and writing skills in English
5. Additional experiences in cancer cell biology or cachexia research
6. Additional skills in machine learning and artificial intelligence

(French)
Les candidat.e.s doivent avoir un diplôme équivalent à un doctorat norvégien en biologie moléculaire, en biologie cellulaire, en informatique ou dans une discipline pertinente similaire. La nomination dépendra de la soutenance publique de la thèse de doctorat en cours d’approbation. Les candidat.e.s doivent être motivé.e.s et doivent avoir de solides compétences en collaboration.

Les qualifications suivantes seront prises en compte pour l’évaluation des candidat.e.s :
1. Analyse bio-informatique des données de séquençage de nouvelle génération (ex. ARN-seq, ATAC-seq)
2. Programmation informatique comme python, R, et d’autre langage de programmation
3. Connaissance de la biologie fondamentale et des sciences de la santé
4. Excellentes compétences orales et écrites en anglais
5. Expériences supplémentaires en biologie cancéreuse ou en recherche sur la cachexie
6. Compétences supplémentaires en apprentissage automatique et en intelligence artificielle


Start date

As soon as possible

How to Apply

(English)
Interested applicants should forward 1) a cover letter, 2) curriculum vitae with full publication list, and 3) three names of reference, all in PDF format to: yoshiaki.tanaka@umontreal.ca

(French)
Les candidat.e.s intéressé.e.s doivent envoyer 1) une lettre de motivation, 2) un curriculum vitae avec la liste complète des publications et 3) trois noms de références. Tous les documents doivent être envoyés au format PDF à : yoshiaki.tanaka@umontreal.ca


Contact

Yoshiaki Tanaka
yoshiaki.tanaka@umontreal.ca